Kursus annab süstemaatilise ülevaate valkude struktuuri hierarhiast ja struktuuri seosest bioloogilise funktsiooniga. Kursuse ülesehituses lähtutakse printsiibist lintsamalt keerulisemale ja korratakse varasemate biokeemiaalaste kursuste käigus omandatud põhiteadmisi detailsemal kujul. Kusruse sisu: Aminohapped - struktuur ja keemilised omadused. Peptiidside, struktuur,
termodünaamiline ja kineetiline stabiilsus. Peptiidide keemiline süntees ja sekveneerimine. Peptiidahela
konformatsioon. Dieedrilised nurgad, Ramachandrani kaart. Valkude kokkupakkimine
(folding) ja denaturatsioon. Mittekovalentsete füüsikalis-keemiliste
interaktsioonide roll valkude struktureerumises. Valkude
struktureerumine in vivo -
molekulaarsed šaperoonid, PDI, PI. Valkude
posttranslatoorne ja keemiline
modifitseerimine. Valkude
glükosüleerimine. Meetodid biopolümeeride ruumilise struktuuri määramiseks:
röntgenkiirte difraktsioon, NMR, elektronmikroskoopia. Valkude struktuuri hierarhia, supersekundaarstruktuur ja domeenide
struktuurne klassifikatsioon. Valkude struktuuri dünaamika.
Transkriptsioonifaktorite struktuur ja toimemehhanismid. Valk–valk ja
valk-nukleiinhape interaktsioonid, molekulaarse äratundmise põhimõtted.
Membraanvalkude struktuuri uurimise metoodikad. Oluliste membraanvalkude
struktuur ja funktsioneerimine. Valgustruktuuride visualiseerimine ja
võrdlemine. Kursusele iseregistreerimise võti: "valk"
- Õpetaja/Teacher: Peep Palumaa